La mejor zona para alojarse en Merowe es, por lo general, en el centro de la ciudad o a orillas del Nilo, ya que ofrece un cómodo acceso a los servicios locales y a los lugares históricos.
El centro de Merowe es el principal centro neurálgico para los visitantes. Es donde encontrará la mayoría de las tiendas locales, pequeños restaurantes y casas de huéspedes. La zona es bastante compacta, lo que facilita el desplazamiento a pie. A menudo se encontrará cerca del mercado local, que ofrece una visión de la vida cotidiana.
Para aquellos interesados en la exploración histórica, lo ideal es alojarse cerca de los sitios arqueológicos de la antigua ciudad de Napata, en particular alrededor de las pirámides de Nuri o Jebel Barkal. Si bien las opciones de alojamiento aquí pueden estar más limitadas a albergues o casas de huéspedes específicos de patrimonio, ofrecen un acceso inigualable a estas magníficas estructuras antiguas.